백골단은 여러모로 악명을 떨쳤는데 시위진압 중 1991년 4월 당시 명지대생이었던 강경대를 이들이 진압하면서 철근이 든 죽도와 쇠파이프로 때려죽이는 사건이 벌어지면서 악명을 떨쳤다. 당시 강경대는 시위대에서 사실상 낙오된 상황이었고 학교 담을 넘어 도주하던 중 백골단 5명에게 철근이 들어간 죽도와 쇠파이프로 두부를 구타당한 후 길거리에 버려졌으며 병원으로 이송됐지만 곧 사망하였다. 강경대를 살해한 백골단 대원들은 공판에서 반성은 커녕 오히려 강경대에게 있지도 않은 화염병 혐의를 뒤집어씌웠고 이에 분노한 민가협 회원들이 공판을 아수라장으로 만들기까지 했다. ‘강경대 치사사건’ 첫 공판서 유가협 울분 폭발, 자식을 가슴에 품은... 강경대 열사 아버지

강경대 사망 사건에 항의하는 시위 와중에 5월 성균관대생 김귀정도 경찰에게 집단구타당해 사망했다. 그래서 성균관대 명륜캠퍼스엔 "김귀정 생활도서관"이라는 동아리가 지금까지 내려온다. 사후 김귀정의 유족이 백골단의 폭력진압으로 사망한 것으로 국가배상청구 소송을 걸었고 정부에서 거부했다가 대법원에서 공무원을 특정할 수 없더라도 국가배상을 인정할 수 있다고 판결하였다(95다23897)

1996년 3월 연세대 노수석도 일명 토끼몰이 진압 와중에 사망했다는 시위대 측의 주장이 있다.[56]

백골단에 의해서 사람이 죽는 일도 존재했기 때문에 중경상을 입는 경우는 다반사였다. 1980~90년대에 전교조 주도의 소위 '참교육 운동'을 전후해 발생한 '고등학생운동(이하 고운)' 활동 2006년 제10호, 2016년 7월 시사in 기사도 참고할 것." href="https://namu.wiki/w/%EB%B0%B1%EA%B3%A8%EB%8B%A8#fn-57" data-v-0093a003="" style="white-space: nowrap; box-sizing: border-box; color: rgb(0, 0, 0); text-decoration-style: solid; text-decoration-color: currentcolor; transition: color 0.05s ease-in; font-size: 0.8em; vertical-align: super; font-family: "Pretendard JP", Pretendard, -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Apple SD Gothic Neo", "Noto Sans KR", "Noto Sans CJK KR", NanumBarunGothic, Roboto, "Segoe UI", "Malgun Gothic", "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", sans-serif, emoji; -webkit-text-size-adjust: 100%;">[57]을 했던 고등학교 시위대도 있었는데 백골단에 의해서 진압된 고등학생 시위자의 어지간한 뼈마디가 모두 골절된 경우도 있었다지만 언론에는 안 나왔다고 한다.

1991년 5월 7일에 백골단은 한진중공업 노조위원장 박창수[58]의 빈소로 쳐들어가 영안실 벽을 깨부수고 박창수의 시신을 탈취하기도 했다.

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1991년에 안양병원 영안실로 난입한 백골단들. 이들은 영안실 벽을 뚫어 박창수 노조위원장의 시신을 탈취해갔다.

시신까지 탈취하는 범죄집단을 자칭하니 참 자랑스럽겠다야